18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4635 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  564  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  58.46 
 
 
276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3341  hypothetical protein  33.9 
 
 
259 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  0.171376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  31.25 
 
 
288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  31.85 
 
 
288 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0581  hypothetical protein  30.43 
 
 
335 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  34.13 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  26.09 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  28.57 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  30.13 
 
 
297 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  26.97 
 
 
260 aa  55.5  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3342  hypothetical protein  21.91 
 
 
232 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.162621 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  32 
 
 
322 aa  48.9  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  21.21 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  30.3 
 
 
257 aa  45.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  32.35 
 
 
323 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  23.6 
 
 
276 aa  42.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  22.4 
 
 
262 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>