14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3342 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3342  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.162621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3341  hypothetical protein  30.83 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  0.171376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4230  hypothetical protein  27.53 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  23.5 
 
 		 318 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  22.95 
 
 		 318 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  30.68 
 
 		 279 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  24.72 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  22.95 
 
 		 318 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  30.63 
 
 		 337 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  21.4 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  24.02 
 
 		 315 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  24 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5605  hypothetical protein  27.08 
 
 		 361 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11203  hypothetical protein  24.86 
 
 		 368 aa  42.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.315022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>