19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1128 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  555  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  58.46 
 
 
279 aa  305  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3341  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  0.171376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0581  hypothetical protein  33.92 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  29.79 
 
 
288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  27.99 
 
 
288 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  30.14 
 
 
254 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  22.01 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  25.77 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  36.63 
 
 
322 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  26.29 
 
 
347 aa  52.4  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  38.71 
 
 
323 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  30.77 
 
 
330 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  23.98 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3342  hypothetical protein  24 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.162621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  29.33 
 
 
257 aa  43.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0639  hypothetical protein  21.01 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  22.92 
 
 
337 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  22.63 
 
 
308 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>