24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4634 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  589  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  58.7 
 
 
288 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1128  hypothetical protein  31.96 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000110523  normal  0.330869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  32.14 
 
 
279 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  23.57 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3341  hypothetical protein  29.27 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  0.171376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0581  hypothetical protein  24.79 
 
 
335 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  23.81 
 
 
258 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  23.53 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  26.42 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  25.11 
 
 
297 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  29.19 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  22.58 
 
 
277 aa  50.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1396  hypothetical protein  24.35 
 
 
300 aa  49.3  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.107997  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  24.79 
 
 
318 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  24.14 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  31.96 
 
 
318 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  31.96 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  22.66 
 
 
318 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  23.38 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  24.82 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  28.37 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  30.93 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2166  hypothetical protein  29.17 
 
 
370 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>