49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3842 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  88.68 
 
 		 318 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  88.99 
 
 		 318 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  87.74 
 
 		 318 aa  568  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  78.16 
 
 		 318 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  73.9 
 
 		 318 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  74.53 
 
 		 318 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  74.21 
 
 		 318 aa  481  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  73.9 
 
 		 318 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  47.59 
 
 		 312 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  47.62 
 
 		 315 aa  285  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  48.34 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  47.57 
 
 		 313 aa  275  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  46.1 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  45.86 
 
 		 309 aa  250  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  34.81 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  33 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  28.94 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  26.42 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  30.93 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  24.88 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  26.19 
 
 		 358 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  36.27 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  26.79 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  33.67 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  27.5 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  24.6 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  26.37 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  24.45 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  25.17 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  23.2 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  24.09 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  23.47 
 
 		 417 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  29.5 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  24.56 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  25.97 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  24.14 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  25.81 
 
 		 288 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  26.58 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  32.35 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  28.19 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  25.55 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2390  hypothetical protein  30.07 
 
 		 280 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.676322  normal  0.375551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  25.1 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  27.03 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  21.92 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  24.34 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  30.5 
 
 		 274 aa  42.4  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>