54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2233 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  659    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  37.5 
 
 		 297 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  33.97 
 
 		 264 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  34.76 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  29.67 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  33.87 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  32.27 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  32.86 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  28.47 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  32.77 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  35.53 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  31.21 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  32.61 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  31.44 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  35.1 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  36.5 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  32.7 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  26.58 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  30.06 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  31.97 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  31.62 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  27.82 
 
 		 321 aa  52.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  25.95 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  29.06 
 
 		 358 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  26.36 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  24.77 
 
 		 318 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  25.82 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  28.89 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  24.9 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  24.77 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  28.75 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  32.76 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  26.28 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  24.77 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  30.61 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  36.26 
 
 		 456 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  26.77 
 
 		 219 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  31.84 
 
 		 323 aa  47  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  31.9 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  32.69 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  26.24 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  29.31 
 
 		 275 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1037  hypothetical protein  25.58 
 
 		 303 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000304266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  27.23 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2431  hypothetical protein  28.57 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.482444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  26.32 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  27.7 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  28.19 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  28.86 
 
 		 275 aa  44.3  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  25.53 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  35.34 
 
 		 258 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  30.06 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  29.69 
 
 		 265 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  41.11 
 
 		 234 aa  42.7  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>