39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2648 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  550  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  74.63 
 
 
275 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  39.83 
 
 
307 aa  148  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  30.47 
 
 
283 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  30.74 
 
 
274 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  29.75 
 
 
284 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  31.47 
 
 
274 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  23.53 
 
 
284 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  31.11 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  33.33 
 
 
358 aa  75.5  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  35.53 
 
 
330 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  36.27 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  22.69 
 
 
315 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  30.09 
 
 
318 aa  58.9  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  34.38 
 
 
293 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  27.93 
 
 
314 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  29.01 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  31.53 
 
 
312 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  31.4 
 
 
318 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  31.79 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  33.33 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  28.57 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  29.01 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  29.01 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  32.35 
 
 
318 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  34.88 
 
 
309 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  32.74 
 
 
323 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  26.5 
 
 
315 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  33.02 
 
 
313 aa  52.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  27.43 
 
 
322 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  24.1 
 
 
321 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  28.66 
 
 
268 aa  47  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  21.08 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  28.86 
 
 
343 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  25.33 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1037  hypothetical protein  32.14 
 
 
303 aa  43.5  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000304266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  26.46 
 
 
280 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  24.59 
 
 
265 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>