39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3320 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  514  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  37.2 
 
 
322 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0241  hypothetical protein  30.52 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.981785  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  32.09 
 
 
276 aa  93.6  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1968  hypothetical protein  28.46 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  29.02 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  34.71 
 
 
350 aa  63.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1127  hypothetical protein  26.71 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000499877  normal  0.311509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  25.99 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  27.5 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  23.03 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  27.04 
 
 
417 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  25.94 
 
 
417 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  22.77 
 
 
258 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4634  hypothetical protein  22.52 
 
 
288 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  22.05 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  21.83 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  21.15 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  27.74 
 
 
297 aa  49.3  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  22.39 
 
 
302 aa  49.3  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  25.25 
 
 
267 aa  48.9  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1396  hypothetical protein  22.18 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.107997  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4635  hypothetical protein  21.21 
 
 
279 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91802  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  30.07 
 
 
358 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  22.14 
 
 
258 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  21.08 
 
 
275 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  21.51 
 
 
257 aa  46.2  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  29.93 
 
 
347 aa  46.2  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  21.47 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  29.17 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  26.89 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0639  hypothetical protein  24.07 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  28.7 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0502  hypothetical protein  21.84 
 
 
288 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000554513  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  27.27 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  22.67 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  32.79 
 
 
275 aa  42.4  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  27.16 
 
 
273 aa  42.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>