26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08200 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  100 
 
 
275 aa  549  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  25.29 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  22.31 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  24.59 
 
 
231 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  25.14 
 
 
308 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  24.35 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  24.89 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  24.34 
 
 
276 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  23.89 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  22.36 
 
 
302 aa  48.9  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0221  hypothetical protein  23.5 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  30.57 
 
 
264 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  36.89 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  29.06 
 
 
318 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  24.63 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5605  hypothetical protein  21.16 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  21.43 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  25.29 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  23.73 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  24.22 
 
 
313 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  29.09 
 
 
348 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  36.25 
 
 
297 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  24.71 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  26.36 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  32.79 
 
 
277 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  23.12 
 
 
234 aa  42.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>