61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5813 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  562  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  36.89 
 
 		 307 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  35.84 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  29.37 
 
 		 343 aa  89.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  29.76 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  25.87 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  32.05 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  27.96 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  31.8 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  29.61 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  29.22 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  27.08 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  26.61 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  26.88 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  26.88 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  33.85 
 
 		 348 aa  58.9  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  27.67 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  25.16 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  26.75 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  27.64 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  27.97 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  28.93 
 
 		 417 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  28.17 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  27.74 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  29.45 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  24.03 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  24.68 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  28.74 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  27.96 
 
 		 417 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  26.23 
 
 		 252 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  34.15 
 
 		 225 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  29.45 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  30.86 
 
 		 222 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  28.05 
 
 		 229 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  28.83 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  24.64 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  32.61 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  28.39 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  23.31 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  24.64 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  26.44 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  24.64 
 
 		 318 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  34.21 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  24.64 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  27.92 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  30.66 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  24.06 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  37.33 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  24.82 
 
 		 257 aa  43.1  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  28.83 
 
 		 229 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  28.22 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  36.25 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  39.39 
 
 		 221 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>