25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2026 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  40.71 
 
 
212 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  36.94 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  36.49 
 
 
223 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  31.67 
 
 
282 aa  125  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  32.74 
 
 
281 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  35.65 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  30.39 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  38.64 
 
 
280 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  33.64 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  35.75 
 
 
221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  32.74 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  29.47 
 
 
296 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  28.93 
 
 
281 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  28.47 
 
 
290 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  31.34 
 
 
289 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  31.09 
 
 
265 aa  96.3  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  29.06 
 
 
281 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  31.94 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  27.43 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  24.75 
 
 
307 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  24.81 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08200  bacteriocin-type signal sequence  23.12 
 
 
275 aa  42.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>