34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  590  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  36.69 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  33.19 
 
 		 280 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  27.27 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  27.5 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  26.23 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  34.76 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  28.14 
 
 		 282 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  27.84 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  32.33 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  27.07 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  27.04 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  29.46 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  28.22 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  30.26 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  25.24 
 
 		 229 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  29.82 
 
 		 348 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  28.18 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  30.91 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  28.74 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  27.53 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  27.53 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  24.12 
 
 		 264 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  29.94 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  29.78 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  24.75 
 
 		 234 aa  49.7  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  27.22 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  30.77 
 
 		 330 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  31.21 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  24.3 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  26.38 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  22.81 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  31.03 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  25.53 
 
 		 347 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>