39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4941 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  517  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  43.06 
 
 		 280 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  45.74 
 
 		 280 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  43.46 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  39.01 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  40.21 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  35.46 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  34.74 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  36.3 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  32.98 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  32.31 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  31.15 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  28.68 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  30.04 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  33.58 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  30 
 
 		 221 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  31.09 
 
 		 234 aa  95.5  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  31.54 
 
 		 219 aa  95.5  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  32.18 
 
 		 221 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  28.57 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  33.04 
 
 		 225 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  26.23 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  25.52 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  28.16 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  29.41 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  29.51 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  33.93 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  28.47 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  29.93 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  22.06 
 
 		 417 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  32.97 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  25.5 
 
 		 257 aa  47  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  32.85 
 
 		 417 aa  46.2  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  30.58 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  21.95 
 
 		 321 aa  42  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  23.93 
 
 		 358 aa  42  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  24.59 
 
 		 275 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>