28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0395 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  434  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  66.52 
 
 		 225 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  64.86 
 
 		 221 aa  280  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  58.74 
 
 		 223 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  57.4 
 
 		 223 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  50.23 
 
 		 219 aa  211  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  48.43 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  47 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  30.22 
 
 		 280 aa  111  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  36.67 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  29.82 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  35.94 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  30.04 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  35.51 
 
 		 289 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  35.94 
 
 		 281 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  35.03 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  35.35 
 
 		 290 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  29.88 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  32.44 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  32.99 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  27.32 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  28.18 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  24.79 
 
 		 298 aa  55.1  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  30.86 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  24.73 
 
 		 274 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  34.38 
 
 		 322 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  29.05 
 
 		 337 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>