27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0455 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  67.26 
 
 		 223 aa  292  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  65.02 
 
 		 223 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  61.36 
 
 		 219 aa  262  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  55.16 
 
 		 221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  52.91 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  53.64 
 
 		 225 aa  214  7e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  48.43 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  38.33 
 
 		 280 aa  122  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  32.01 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  33.69 
 
 		 289 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  35.75 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  31.54 
 
 		 280 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  37.77 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  34.07 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  32.62 
 
 		 281 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  37.65 
 
 		 281 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  32.73 
 
 		 296 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  30 
 
 		 265 aa  98.2  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  34.23 
 
 		 290 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  29.29 
 
 		 282 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  27.37 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  24.36 
 
 		 274 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  26.61 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  30.91 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  26.75 
 
 		 337 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  39.39 
 
 		 297 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>