28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0215 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  97.31 
 
 		 223 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  65.02 
 
 		 221 aa  287  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  63.96 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  62.33 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  57.4 
 
 		 222 aa  248  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  56.76 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  56.48 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  41.11 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  39.09 
 
 		 280 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  36.49 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  33.91 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  30.6 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  31.15 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  31.18 
 
 		 281 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  29.03 
 
 		 290 aa  108  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  29.12 
 
 		 296 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  29.29 
 
 		 282 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  34.21 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  30.3 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  23.72 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  26.81 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  27.53 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1002  protein of unknown function DUF1707  31.03 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  27.87 
 
 		 337 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  36.36 
 
 		 297 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>