25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4275 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  424  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  64.86 
 
 		 222 aa  280  9e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  63.68 
 
 		 223 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  63.93 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  62.33 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  55.16 
 
 		 221 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  56.56 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  49.54 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  39.43 
 
 		 280 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  35.59 
 
 		 212 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  31.16 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  38.27 
 
 		 289 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  36.73 
 
 		 290 aa  95.1  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  35.87 
 
 		 282 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  32.18 
 
 		 265 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  36.28 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  29.5 
 
 		 281 aa  90.1  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  30.14 
 
 		 296 aa  88.2  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  34.63 
 
 		 281 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  31.05 
 
 		 281 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  29.05 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  27.04 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  31.21 
 
 		 307 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  37.33 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>