63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1718 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  31.65 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  32.48 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  35.84 
 
 		 297 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  28.93 
 
 		 281 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  28.86 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  29.14 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  32.08 
 
 		 264 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  31.72 
 
 		 290 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  33.62 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  30.57 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  30.99 
 
 		 296 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 258 aa  87  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  30.77 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  28.51 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  28.94 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  29.74 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  29.25 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  25.98 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  28.3 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  34.13 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  28.07 
 
 		 258 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  30.49 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  30.49 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  30.49 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  31.1 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  31.4 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  26.99 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  38.3 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  25.52 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  27.35 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  29.18 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  27.04 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  22.51 
 
 		 456 aa  62.4  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  29.14 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  28.26 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  30.1 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  29.79 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  31.37 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  28.72 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  33.56 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  29.82 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  35.61 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  31.62 
 
 		 343 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  28.33 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  28.1 
 
 		 222 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  30.83 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1611  hypothetical protein  40.14 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.55179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  28.99 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  25.68 
 
 		 417 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  39.18 
 
 		 277 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  37.76 
 
 		 231 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  28.7 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  37.11 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1282  hypothetical protein  23.81 
 
 		 405 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000743125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  24.81 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  31.63 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  30.56 
 
 		 350 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  22.06 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  23.73 
 
 		 260 aa  42.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  28.37 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>