40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2435 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  57.5 
 
 		 280 aa  315  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  50 
 
 		 289 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  48.57 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  45.74 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  44.33 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  41.99 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  39.16 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  38.08 
 
 		 281 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  36.07 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  41.67 
 
 		 223 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  41.11 
 
 		 223 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  42.46 
 
 		 219 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  38.33 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  38.64 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  39.43 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  35.94 
 
 		 222 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  31.82 
 
 		 229 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  37.79 
 
 		 240 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  32.48 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  33.18 
 
 		 225 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  28.17 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  39.24 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  33.19 
 
 		 307 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  27.42 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  29.67 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  32.54 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  27.52 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  26.61 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  24.58 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  23.35 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  28.07 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  30.73 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  33.76 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  32 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  23.93 
 
 		 347 aa  48.9  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  29.17 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  28.29 
 
 		 417 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  34.41 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  30.26 
 
 		 330 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>