23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0980 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  40.71 
 
 
234 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  35.4 
 
 
223 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  33.91 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  35.59 
 
 
221 aa  108  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  36.28 
 
 
219 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  36.02 
 
 
280 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  34.07 
 
 
221 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  35.22 
 
 
229 aa  101  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  37.5 
 
 
281 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  35.03 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  39.24 
 
 
280 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  38.27 
 
 
296 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  31.96 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  27.66 
 
 
290 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  28.2 
 
 
265 aa  87.8  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  37.32 
 
 
282 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  30 
 
 
281 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  32.73 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  33.09 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  31.45 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  28.57 
 
 
264 aa  68.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  28.99 
 
 
298 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>