39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4138 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  544  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  50 
 
 		 280 aa  256  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  47.5 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  41.99 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  40.21 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  39.72 
 
 		 282 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  39.79 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  38.57 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  37.06 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  36.75 
 
 		 281 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  33.69 
 
 		 223 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  39.57 
 
 		 219 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  33.69 
 
 		 221 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  29.68 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  35.51 
 
 		 222 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  32.4 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  38.27 
 
 		 221 aa  99  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  30.28 
 
 		 234 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  30.4 
 
 		 225 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  28.86 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  37.21 
 
 		 240 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  27.59 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  29.21 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  28.3 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  31.45 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  31.44 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  27.67 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  28.4 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  26.06 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  31.53 
 
 		 417 aa  48.9  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  23.38 
 
 		 258 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  33.9 
 
 		 337 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  29.2 
 
 		 417 aa  45.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  34.81 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  21.85 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  39.53 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  24.5 
 
 		 314 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  24.11 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>