53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3130 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  35.71 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  34.29 
 
 
280 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  36.07 
 
 
280 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  38.57 
 
 
289 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  35.66 
 
 
296 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  36.3 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  36.04 
 
 
281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  34.29 
 
 
282 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  32.14 
 
 
281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  29.08 
 
 
264 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  36.75 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  30 
 
 
223 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  28.47 
 
 
234 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  28.93 
 
 
223 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  32.16 
 
 
229 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  35.35 
 
 
222 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  34.23 
 
 
221 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  36.73 
 
 
221 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  31.72 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  27.66 
 
 
212 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  33.17 
 
 
225 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  27.03 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  32.33 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  29.93 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  31.93 
 
 
297 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  34.18 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  26.76 
 
 
252 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  35.1 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  27.23 
 
 
417 aa  56.2  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  25.55 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  30.71 
 
 
347 aa  52.4  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3297  hypothetical protein  23.56 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.016193  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  23.66 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  22.3 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  28.3 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  20.74 
 
 
258 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  20.74 
 
 
258 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  20 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  19.26 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  19.26 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  32.26 
 
 
350 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  20.9 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  30.84 
 
 
350 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  20 
 
 
258 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  29.91 
 
 
417 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  18.52 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  21.9 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  28.67 
 
 
337 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  31.5 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  30.33 
 
 
308 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  28.17 
 
 
314 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  24.63 
 
 
256 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>