41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0285 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  40 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  39.65 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  40.56 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  39.16 
 
 		 280 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  35.56 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  34.74 
 
 		 265 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  37.06 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  35.66 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  34.86 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  29.47 
 
 		 234 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  29.37 
 
 		 223 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  28.67 
 
 		 223 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  32.73 
 
 		 221 aa  98.6  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  38.27 
 
 		 212 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  28.12 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  32.99 
 
 		 222 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  30.14 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  26.46 
 
 		 240 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  28.11 
 
 		 225 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  30.99 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  27.46 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  28.12 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  25.7 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  32.05 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  29.47 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  32.61 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  26.49 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  30.71 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  28.74 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  30.51 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  31.34 
 
 		 348 aa  49.3  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  23.89 
 
 		 280 aa  49.3  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  24.85 
 
 		 257 aa  49.3  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  20.15 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  25.53 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  27.05 
 
 		 251 aa  46.6  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  27.52 
 
 		 350 aa  46.6  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  27.05 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12640  hypothetical protein  31.86 
 
 		 325 aa  42.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281353  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  24.81 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>