51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0135 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  100 
 
 		 251 aa  479  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  58.97 
 
 		 251 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  55.79 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0138  putative lipoprotein  53.04 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0138  putative lipoprotein  52.4 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0143  putative lipoprotein  53.04 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.395168 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  50.4 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  48.63 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0141  putative lipoprotein  49.39 
 
 		 257 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0144  putative lipoprotein  49.6 
 
 		 260 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4215  putative lipoprotein  49.41 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0140  putative lipoprotein  49.6 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0143  lipoprotein, putative  49.01 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0757  putative lipoprotein  51.39 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  48.66 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  44.94 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  28.51 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01218  hypothetical protein  25.93 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.14576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  30.71 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  24.51 
 
 		 417 aa  55.1  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  24.06 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  25.88 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  26.6 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  27.74 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  25.9 
 
 		 348 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  23.33 
 
 		 281 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  22.3 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  28.57 
 
 		 358 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2623  putative secreted protein  27.87 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0372245  normal  0.175706 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  36.36 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  24.8 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  24.52 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  27.91 
 
 		 229 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  19.05 
 
 		 323 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  26.03 
 
 		 309 aa  45.4  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  25.21 
 
 		 417 aa  45.4  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  24.67 
 
 		 282 aa  45.4  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  24.31 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  29.77 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1818  hypothetical protein  29.27 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  21.76 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  27.88 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  31.86 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3351  hypothetical protein  27.34 
 
 		 670 aa  43.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  27.88 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  31.43 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  27.88 
 
 		 318 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  26.18 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  21.83 
 
 		 280 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  41.86 
 
 		 3954 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>