36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4525 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  100 
 
 
417 aa  848    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  31.58 
 
 
297 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  30.46 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  27.27 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  26.12 
 
 
347 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  29.19 
 
 
348 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  29.26 
 
 
308 aa  63.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  25.94 
 
 
277 aa  54.3  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  30.3 
 
 
280 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  28.19 
 
 
417 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  23.94 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  23.47 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  24.5 
 
 
318 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  26.13 
 
 
350 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  23.19 
 
 
318 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  28.44 
 
 
297 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  24.09 
 
 
256 aa  50.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  22.83 
 
 
251 aa  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  24 
 
 
318 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  25.68 
 
 
298 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  32.85 
 
 
265 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  27.66 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  26.38 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  24.21 
 
 
318 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  25.21 
 
 
251 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  29.91 
 
 
290 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  29.2 
 
 
289 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  26.22 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  26.22 
 
 
318 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  28.29 
 
 
280 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  29.9 
 
 
276 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  22.61 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  25.64 
 
 
313 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4759  putative lipoprotein  36.07 
 
 
252 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000136687 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  24.41 
 
 
267 aa  43.5  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  26.32 
 
 
262 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>