33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4644 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4644  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  701    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000513005  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4871  hypothetical protein  57.63 
 
 
347 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.723633 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1909  hypothetical protein  29.13 
 
 
308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4697  hypothetical protein  41.72 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4525  peptidase S7  27.27 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  37.06 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  30.18 
 
 
297 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  25.2 
 
 
280 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  28.08 
 
 
262 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  22.29 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  22.07 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4369  putative lipoprotein  25.81 
 
 
251 aa  54.3  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  25.71 
 
 
267 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  27.35 
 
 
273 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1859  hypothetical protein  29.76 
 
 
397 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000288231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  23.74 
 
 
348 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0135  putative lipoprotein  25.38 
 
 
251 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  24.92 
 
 
314 aa  50.8  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  27.18 
 
 
276 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  24.32 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  26.34 
 
 
417 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  30.84 
 
 
290 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  25.93 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  35.04 
 
 
229 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2046  hypothetical protein  21.72 
 
 
444 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  24.07 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  22.42 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  22.05 
 
 
323 aa  44.3  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0031  hypothetical protein  25.71 
 
 
289 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000287545  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94419  predicted protein  23.68 
 
 
2525 aa  43.5  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  28.21 
 
 
321 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  24.62 
 
 
277 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  29.32 
 
 
337 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>