29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0500 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0500  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5014  hypothetical protein  65.32 
 
 		 223 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0215  hypothetical protein  63.96 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0455  hypothetical protein  61.36 
 
 		 221 aa  262  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0395  hypothetical protein  50.23 
 
 		 222 aa  211  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0714625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4275  hypothetical protein  56.56 
 
 		 221 aa  210  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.411558  normal  0.289102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7475  hypothetical protein  51.36 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0800032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2782  hypothetical protein  49.56 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  42.46 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  33.45 
 
 		 289 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  32.5 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2026  hypothetical protein  32.74 
 
 		 234 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.0719661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3130  hypothetical protein  36.75 
 
 		 290 aa  108  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.526087  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  31.9 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0980  hypothetical protein  36.28 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  29.5 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  38.33 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7593  hypothetical protein  34.38 
 
 		 281 aa  102  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  36.48 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  31.15 
 
 		 265 aa  98.6  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  27.46 
 
 		 296 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  31.28 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  27.9 
 
 		 298 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  29.94 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  24.82 
 
 		 274 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  26.77 
 
 		 343 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  34.21 
 
 		 297 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  29.91 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  25.56 
 
 		 337 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>