24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0337 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0337  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  545  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0544392  decreased coverage  0.00047063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1718  hypothetical protein  29.25 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4138  hypothetical protein  29.21 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.422936 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4941  hypothetical protein  29.51 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25300  hypothetical protein  33.75 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  27.68 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  24.65 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5813  hypothetical protein  26.88 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0961  hypothetical protein  24.83 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0391044  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2435  hypothetical protein  27.05 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0576023  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5832  hypothetical protein  24.81 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2084  hypothetical protein  26.51 
 
 		 281 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0285  hypothetical protein  23.89 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1187  hypothetical protein  24.26 
 
 		 282 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  unclonable  0.00000889667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4409  hypothetical protein  25.26 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0279913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  26.28 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  26.19 
 
 		 417 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  31.36 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  27.36 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  23.14 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3176  putative lipoprotein  24.81 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0150  putative lipoprotein  23.08 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  25.45 
 
 		 348 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.511765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>