47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3677 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  541  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8286  hypothetical protein  43.85 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0564  hypothetical protein  42.45 
 
 
284 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3683  hypothetical protein  42.86 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  32.29 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2648  hypothetical protein  30.74 
 
 
275 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.011435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  30.94 
 
 
275 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1212  hypothetical protein  31.02 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1268  hypothetical protein  30.73 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.529017  normal  0.258885 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2940  hypothetical protein  28.22 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0528092  normal  0.936687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3729  hypothetical protein  31.76 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  28.5 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3320  hypothetical protein  29.02 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  28.7 
 
 
337 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1227  hypothetical protein  31.44 
 
 
358 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.27751  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2613  hypothetical protein  31.25 
 
 
322 aa  62.4  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.116388  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  25.45 
 
 
318 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3173  hypothetical protein  28.14 
 
 
313 aa  59.3  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2958  hypothetical protein  24.65 
 
 
315 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.999381  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09520  hypothetical protein  28.65 
 
 
284 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03770  hypothetical protein  25.13 
 
 
322 aa  55.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  30.04 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3745  hypothetical protein  28.19 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2613  hypothetical protein  25.28 
 
 
309 aa  54.7  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0844  hypothetical protein  27.65 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00516846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  27.13 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  27.13 
 
 
318 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2436  hypothetical protein  26.85 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0241  hypothetical protein  32.89 
 
 
267 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.981785  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  27.42 
 
 
318 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  27.13 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0761  hypothetical protein  31.82 
 
 
318 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116705  normal  0.967896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  24.85 
 
 
321 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  31.06 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1037  hypothetical protein  25.35 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.582529  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2233  hypothetical protein  30.61 
 
 
343 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000729926  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4362  hypothetical protein  26.72 
 
 
321 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  25.4 
 
 
254 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  22.1 
 
 
302 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3842  hypothetical protein  26.58 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3506  hypothetical protein  26.06 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.243271  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4591  hypothetical protein  24.46 
 
 
262 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0305466  normal  0.660382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4063  hypothetical protein  28.12 
 
 
714 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5148  hypothetical protein  31.19 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  34.57 
 
 
307 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  27.56 
 
 
323 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  28.48 
 
 
350 aa  42  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>