27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0331 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  598  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  34.67 
 
 
323 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  28.18 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  30.69 
 
 
267 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  27.98 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0213  hypothetical protein  25.78 
 
 
350 aa  63.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  25.81 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  27.7 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  23.57 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  30.08 
 
 
234 aa  53.1  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  23.08 
 
 
417 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  28.48 
 
 
229 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  28.16 
 
 
266 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  25.21 
 
 
330 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  26.51 
 
 
283 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  25.97 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3102  hypothetical protein  32.67 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.198997  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0820  putative lipoprotein  23.76 
 
 
258 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0789  hypothetical protein  31.13 
 
 
318 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.122176  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  31.18 
 
 
231 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  27.78 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3177  hypothetical protein  30.19 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.292767  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4276  hypothetical protein  27.46 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.958876  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1396  hypothetical protein  35.29 
 
 
300 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.107997  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3677  hypothetical protein  34.57 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0035  putative lipoprotein  24.22 
 
 
256 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35900  hypothetical protein  24.53 
 
 
348 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.511765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>