21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0163 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0163  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  674    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2130  hypothetical protein  24.03 
 
 
430 aa  59.3  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0384361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2989  hypothetical protein  24.61 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0713  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  57.4  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.739266  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0762  hypothetical protein  25.47 
 
 
273 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.048083 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1884  hypothetical protein  30.77 
 
 
170 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000308697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3740  hypothetical protein  38.24 
 
 
321 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000481763  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1965  membrane protein-like protein  23.81 
 
 
456 aa  47.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00793753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3397  hypothetical protein  25 
 
 
267 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1832  hypothetical protein  29.84 
 
 
254 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0995029  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3728  hypothetical protein  26.09 
 
 
268 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3755  hypothetical protein  23.79 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3446  hypothetical protein  24.64 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3481  hypothetical protein  23.79 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.02728  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1859  hypothetical protein  25.59 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000288231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0875  hypothetical protein  21.9 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3709  hypothetical protein  23.79 
 
 
268 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12968e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7567  hypothetical protein  29.89 
 
 
293 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.821021  normal  0.888689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0041  hypothetical protein  32.22 
 
 
280 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  23.6 
 
 
302 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  20.51 
 
 
337 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>