More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0679 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  100 
 
 		 308 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  92.86 
 
 		 308 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  93.18 
 
 		 309 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  83.44 
 
 		 308 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  85.02 
 
 		 308 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  84.36 
 
 		 326 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  62.95 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  55.48 
 
 		 308 aa  320  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  62.91 
 
 		 308 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  54.97 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  54.64 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  54.64 
 
 		 306 aa  292  4e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  56.03 
 
 		 310 aa  287  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  53.44 
 
 		 306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  53.11 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  51.67 
 
 		 305 aa  285  7e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  51.31 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  50 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  50 
 
 		 306 aa  281  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  47.39 
 
 		 310 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  51.8 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  55.37 
 
 		 304 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  49.32 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  52.43 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  51.8 
 
 		 309 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  53.64 
 
 		 305 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  55.67 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  51.15 
 
 		 309 aa  267  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  49.5 
 
 		 306 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 306 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  47.71 
 
 		 309 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  51.88 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  55.67 
 
 		 305 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  47.3 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  53.67 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  48.75 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  50.33 
 
 		 308 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  52.78 
 
 		 310 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  52.67 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  53.05 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  48.34 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  47.97 
 
 		 306 aa  248  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  52.67 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  49.46 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  51.71 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  48.11 
 
 		 306 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  48.11 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  50 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  48.11 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  49.67 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  49.48 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.95 
 
 		 306 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  51 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  47.1 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  54.14 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  54.14 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  50 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  46.84 
 
 		 306 aa  231  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  43.65 
 
 		 313 aa  231  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  52.65 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  52.81 
 
 		 308 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  49.65 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  48.04 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  51.99 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  52.65 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  47.9 
 
 		 296 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.08 
 
 		 314 aa  198  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  39.41 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  40.55 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  43.06 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  48.41 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 290 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  39.05 
 
 		 314 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  39.41 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  42.66 
 
 		 311 aa  189  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  39.17 
 
 		 314 aa  188  9e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  43.1 
 
 		 310 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 321 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  41.99 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  40.26 
 
 		 311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  40.95 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  41.21 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  37.66 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.89 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.22 
 
 		 425 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5334  inner-membrane translocator  39.68 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  44.84 
 
 		 290 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>