More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1409 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  54.72 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  50.65 
 
 		 305 aa  287  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  49.02 
 
 		 310 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  49.84 
 
 		 319 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  53.18 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  47.99 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  46.45 
 
 		 309 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  45.07 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  46.51 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  44.81 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.93 
 
 		 305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 311 aa  238  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  43.17 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  45 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  47.35 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  45 
 
 		 309 aa  235  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  41.23 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  42.53 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  44.95 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  44.84 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  42.53 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  43.65 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  45 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 308 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  42.44 
 
 		 306 aa  228  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  42.44 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  45.22 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  43.04 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  42.67 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  42.67 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  42.16 
 
 		 314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  42.02 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 306 aa  222  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  42.86 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  41.23 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.23 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  41.23 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  40.58 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  41.8 
 
 		 310 aa  218  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  43.09 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  45.79 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  43.27 
 
 		 307 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  43.61 
 
 		 306 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  40.58 
 
 		 304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  42.19 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  39.55 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  43.05 
 
 		 306 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  41.35 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  44.75 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 306 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  42.03 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  41.32 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  42.37 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  43.51 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  41.27 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 307 aa  195  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 312 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  38.71 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 314 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2228  inner-membrane translocator  47.98 
 
 		 219 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 346 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.7 
 
 		 314 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  36.89 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  35.15 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 440 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  35.87 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  33.75 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  33.54 
 
 		 321 aa  176  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  33.44 
 
 		 319 aa  175  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 319 aa  175  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>