More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6462 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  100 
 
 		 303 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  95.71 
 
 		 303 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  51.16 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  49.49 
 
 		 310 aa  261  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  50.49 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  49.16 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  49.67 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  50 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  48.49 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  51.21 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  49.17 
 
 		 326 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  49.17 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  49.33 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  49.34 
 
 		 309 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  49.34 
 
 		 308 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  49.83 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  46.38 
 
 		 306 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  51.39 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  45.07 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  49.5 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  47.37 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  47.04 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  50.17 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  46.86 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  51.74 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  47.04 
 
 		 306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  45.39 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  51.01 
 
 		 306 aa  228  9e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  43.38 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  43.05 
 
 		 307 aa  225  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  51.19 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  48.15 
 
 		 307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  41.81 
 
 		 310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  47.97 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  47.44 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  51.14 
 
 		 306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  47.1 
 
 		 309 aa  215  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  46.03 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  46.03 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  46.03 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  51.84 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  43.46 
 
 		 306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  50 
 
 		 306 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  50.49 
 
 		 306 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  48.96 
 
 		 308 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  48.34 
 
 		 308 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  48 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  43.28 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  48.61 
 
 		 308 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  44.89 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  41.29 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  43.23 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  44.68 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  42.47 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  49.31 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.06 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  41.42 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  43 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  45.49 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  41.55 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  41.18 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  39.65 
 
 		 314 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  42.37 
 
 		 312 aa  165  8e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  42.02 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2022  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  42.7 
 
 		 311 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.45 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4622  ABC transporter permease  34.04 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0459008 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  34.65 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1703  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.209292 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1115  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 314 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  34.49 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3024  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  31.03 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  30.72 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>