More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2058 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  100 
 
 		 304 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  78.22 
 
 		 305 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  71.95 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  60 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  61.24 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  62.17 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  64.8 
 
 		 308 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  60.91 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  56.54 
 
 		 308 aa  321  9.999999999999999e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  66.45 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  65.13 
 
 		 308 aa  315  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  65.79 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  58.39 
 
 		 306 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  62.91 
 
 		 306 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  63.25 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  62.5 
 
 		 304 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  57.19 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  56.33 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  61.64 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  57.72 
 
 		 308 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  57.72 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  58.11 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  59.93 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  50.66 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  53.9 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  51.68 
 
 		 306 aa  279  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  56.86 
 
 		 310 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  56.86 
 
 		 310 aa  278  6e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  56.86 
 
 		 306 aa  277  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  54.7 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  54.36 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  53.67 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  55.37 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  52.3 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  54.7 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 306 aa  271  7e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  51.19 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  56.04 
 
 		 308 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  56.04 
 
 		 309 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  50.34 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  50.87 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  52.51 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  47.87 
 
 		 310 aa  262  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  53.06 
 
 		 309 aa  261  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  52.51 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  50.49 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  51.19 
 
 		 306 aa  255  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  52.25 
 
 		 306 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  51.9 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  51.68 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  53.29 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  53.29 
 
 		 306 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  50 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  51.89 
 
 		 306 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  53 
 
 		 296 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  50.7 
 
 		 303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  50.35 
 
 		 303 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  43.83 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.52 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  49.04 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  50 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  49.15 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  48.69 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  43.65 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  44.92 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  42.67 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  41.28 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  45.42 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 314 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  42.35 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  44.56 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  42.67 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  40.61 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  39.3 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 319 aa  168  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  34.85 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  38.18 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2108  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  35.33 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.84 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.3 
 
 		 322 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>