More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1459 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  100 
 
 		 290 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  83.1 
 
 		 290 aa  422  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  48.24 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  50 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  45.22 
 
 		 313 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  43.09 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 306 aa  208  7e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  47.16 
 
 		 311 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  41.83 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  46.44 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  41.64 
 
 		 308 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  46.58 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  44.19 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  44.9 
 
 		 306 aa  195  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  44.9 
 
 		 306 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  43.27 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  46.62 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  41.75 
 
 		 306 aa  191  8e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  41.23 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  43.54 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.81 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 306 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  42.9 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 314 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  38.7 
 
 		 314 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  41.1 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  44.84 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  44.52 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 306 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  41.16 
 
 		 306 aa  175  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  43.41 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  41.47 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  38.36 
 
 		 319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  41.33 
 
 		 307 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.65 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  44.56 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  42.41 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  41.24 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 309 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  41.92 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 313 aa  168  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  38.25 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 314 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  43 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  46.94 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  45.05 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  42.67 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  36.86 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  43.61 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3578  inner-membrane translocator  41.01 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  40 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  44.04 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  39.87 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  37.7 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  43.49 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  44.56 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  37.96 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 284 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  36.55 
 
 		 284 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5334  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 314 aa  158  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  39.17 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  36.16 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  42.75 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  42.26 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 321 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  37.17 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  39.07 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 310 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  35.28 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>