More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1986 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  99.37 
 
 		 315 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  100 
 
 		 315 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  95.56 
 
 		 315 aa  567  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  79.81 
 
 		 314 aa  478  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  64.38 
 
 		 313 aa  386  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  63.17 
 
 		 314 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  62.86 
 
 		 314 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  62.86 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  62.7 
 
 		 313 aa  378  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  63.14 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  61.59 
 
 		 307 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3992  inner-membrane translocator  63.44 
 
 		 320 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180455  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  61.9 
 
 		 314 aa  355  5.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5334  inner-membrane translocator  64.44 
 
 		 314 aa  349  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  60.06 
 
 		 305 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3578  inner-membrane translocator  58.1 
 
 		 307 aa  339  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0934  inner-membrane translocator  65.08 
 
 		 314 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.509235  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 310 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4145  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  39.68 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  38.41 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  39.03 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  37.22 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  41.02 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  43.05 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  41.21 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  37.21 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.69 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.36 
 
 		 425 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  35.42 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  35.11 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  35.95 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  35.5 
 
 		 346 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  39.3 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  39.3 
 
 		 308 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  36.68 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  40.71 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  39.56 
 
 		 309 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  38.49 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  39.79 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  39.24 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2684  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000451986  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  37.42 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 426 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  38.18 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  34.54 
 
 		 344 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  37.16 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  40.78 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 310 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  30.38 
 
 		 319 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  35.12 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  33.66 
 
 		 447 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  36.93 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  32.05 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 429 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  34.1 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05420  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.27 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.905807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4144  inner-membrane translocator  36.19 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  38.87 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  39.18 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  32.78 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  29.65 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  30.25 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>