More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0215 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  100 
 
 		 308 aa  577  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  98.7 
 
 		 326 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  85.02 
 
 		 308 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  85.99 
 
 		 308 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  85.67 
 
 		 309 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  82.08 
 
 		 308 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  61.97 
 
 		 310 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  54.49 
 
 		 308 aa  315  6e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  62.25 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  57.28 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  56.95 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  58.63 
 
 		 310 aa  296  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  55.96 
 
 		 306 aa  291  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  53.77 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  54.1 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  52.67 
 
 		 305 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  54.75 
 
 		 306 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  54.43 
 
 		 306 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  57.72 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  54.43 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  48.68 
 
 		 306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  48.37 
 
 		 310 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  56.29 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  52 
 
 		 306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  50.52 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  50.84 
 
 		 306 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  56.67 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  54.34 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  56.71 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 307 aa  266  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  49.16 
 
 		 306 aa  265  5.999999999999999e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  51.14 
 
 		 309 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  50.84 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  51.15 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  52.51 
 
 		 306 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  51.15 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 306 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  54.51 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  53.33 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  53 
 
 		 306 aa  252  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  53.61 
 
 		 306 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  47.62 
 
 		 309 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  51.89 
 
 		 306 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  50.5 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  52.24 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  51.2 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  53.42 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  52.23 
 
 		 306 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  52.23 
 
 		 306 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  52.33 
 
 		 306 aa  245  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  51.38 
 
 		 305 aa  241  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  49.48 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  57.28 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  55.21 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  55.21 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  49.17 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  49.17 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  56.29 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.9 
 
 		 306 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  48.68 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  57.28 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  42.67 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  52.45 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  47.16 
 
 		 307 aa  221  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  57.95 
 
 		 308 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  50 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  42.16 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  51.24 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.26 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  42.07 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  40.97 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  40.4 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  38.98 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  44.84 
 
 		 290 aa  187  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  43.65 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.81 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  39.17 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  38.34 
 
 		 314 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 311 aa  178  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  37.28 
 
 		 346 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2228  inner-membrane translocator  52.8 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  39.62 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  37.15 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 305 aa  172  9e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  40.54 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>