More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0568 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 306 aa  591  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  99.35 
 
 		 306 aa  587  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  94.77 
 
 		 306 aa  544  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  75.5 
 
 		 305 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  78.81 
 
 		 304 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  72.88 
 
 		 306 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  73.86 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  71.57 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  61.24 
 
 		 304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  64.07 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  57.05 
 
 		 308 aa  323  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  61.44 
 
 		 305 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  57.52 
 
 		 306 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  57.76 
 
 		 306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  57.52 
 
 		 306 aa  309  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  53.44 
 
 		 310 aa  305  9.000000000000001e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  59.15 
 
 		 305 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  59.25 
 
 		 306 aa  300  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  57.28 
 
 		 308 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  57.28 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  59.59 
 
 		 306 aa  298  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  56.54 
 
 		 310 aa  298  9e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  59.25 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  56.85 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  54.97 
 
 		 308 aa  295  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  61.11 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  55.63 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  54.58 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  55.63 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  55.88 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  55.99 
 
 		 308 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  56.04 
 
 		 310 aa  290  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  55.23 
 
 		 309 aa  289  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  49.67 
 
 		 310 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  56.21 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  61.76 
 
 		 308 aa  288  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  56.52 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  53.92 
 
 		 309 aa  286  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  54.45 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  56.77 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  53.62 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  53.29 
 
 		 306 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  58.05 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  58.05 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  57.19 
 
 		 306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  58.82 
 
 		 306 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  51.69 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  59.48 
 
 		 308 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  61.44 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  46.78 
 
 		 309 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  58.13 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  58.13 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  56.47 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  57.44 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  50 
 
 		 305 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 311 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  55.33 
 
 		 306 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  51.69 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  45.81 
 
 		 308 aa  235  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  49.01 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  53.08 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  42.44 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.93 
 
 		 306 aa  221  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  44.26 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  46.1 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  43.32 
 
 		 306 aa  205  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  44.81 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 311 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  44.9 
 
 		 290 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  40.85 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  38.66 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  38.76 
 
 		 425 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2108  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  42.27 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3024  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  37.18 
 
 		 346 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  40.72 
 
 		 312 aa  176  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.81 
 
 		 322 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  35.26 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  36.76 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0429  inner-membrane translocator  43.13 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.335933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.14 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  36.82 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>