More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1903 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  100 
 
 		 308 aa  594  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  61.69 
 
 		 308 aa  355  3.9999999999999996e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  64.07 
 
 		 306 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  64.07 
 
 		 306 aa  348  8e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  62.37 
 
 		 306 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  62.3 
 
 		 308 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  63.36 
 
 		 305 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  60.86 
 
 		 306 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  62.25 
 
 		 308 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  61.59 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  63.58 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  58.82 
 
 		 306 aa  329  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  63.58 
 
 		 309 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  61.92 
 
 		 326 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  59.48 
 
 		 306 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  61.61 
 
 		 310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  58.88 
 
 		 306 aa  324  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  59.54 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  59.52 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  59.02 
 
 		 306 aa  322  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  59.02 
 
 		 306 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  60.9 
 
 		 306 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  53.9 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  59.64 
 
 		 306 aa  315  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  57.05 
 
 		 309 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  57.68 
 
 		 306 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  57.19 
 
 		 307 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  56.07 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  59.04 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  59.4 
 
 		 306 aa  310  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  55.74 
 
 		 309 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  63.73 
 
 		 304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  59.93 
 
 		 304 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  60.07 
 
 		 306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  62.33 
 
 		 306 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  50.49 
 
 		 310 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  61.64 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  56.7 
 
 		 310 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  61.99 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  59.04 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  60.34 
 
 		 306 aa  292  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  60.43 
 
 		 305 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  58.42 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  58.42 
 
 		 310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  56.06 
 
 		 306 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  56.85 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  57.79 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  57.88 
 
 		 305 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  60.96 
 
 		 308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  56.4 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  56.4 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  52.04 
 
 		 305 aa  267  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  52.56 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  45.93 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  60.41 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  48.22 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  48.05 
 
 		 308 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  61.09 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  53.06 
 
 		 307 aa  248  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  54.95 
 
 		 296 aa  245  8e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  58.08 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  47.17 
 
 		 313 aa  238  9e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  45.78 
 
 		 306 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.33 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  51.54 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  51.19 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 306 aa  225  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  48.69 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  43.1 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  41.44 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  41.82 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  44.57 
 
 		 311 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  40 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  43.31 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  43.54 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.98 
 
 		 314 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 310 aa  179  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  34.98 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  39.66 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 290 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  39.73 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  38.73 
 
 		 310 aa  176  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2228  inner-membrane translocator  50.69 
 
 		 219 aa  175  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  37.04 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3024  inner-membrane translocator  40.43 
 
 		 307 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 314 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  36.42 
 
 		 425 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 445 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  38.55 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>