More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2228 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2228  inner-membrane translocator  100 
 
 		 219 aa  428  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  63.64 
 
 		 310 aa  294  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  62.44 
 
 		 311 aa  258  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  59.55 
 
 		 305 aa  246  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  51.6 
 
 		 309 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  48.85 
 
 		 310 aa  211  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  53.67 
 
 		 308 aa  211  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  51.15 
 
 		 308 aa  207  9e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  54.13 
 
 		 306 aa  205  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  47.98 
 
 		 313 aa  205  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  51.57 
 
 		 311 aa  202  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  48.85 
 
 		 305 aa  198  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  47.2 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  49.77 
 
 		 306 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  50.46 
 
 		 306 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  52.02 
 
 		 311 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  51.16 
 
 		 306 aa  194  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  49.54 
 
 		 307 aa  191  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  49.3 
 
 		 306 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  48.39 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  49.3 
 
 		 306 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  47.49 
 
 		 306 aa  188  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  50.69 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  48 
 
 		 311 aa  186  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  53.27 
 
 		 326 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  52.8 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  51.83 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  50.93 
 
 		 308 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  48.6 
 
 		 306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  47.47 
 
 		 306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  47.47 
 
 		 306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  46.26 
 
 		 306 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  47.47 
 
 		 306 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  46.54 
 
 		 306 aa  182  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  46.79 
 
 		 306 aa  181  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  52.11 
 
 		 308 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  52.11 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  55.05 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  48.84 
 
 		 306 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  50.93 
 
 		 308 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  46.08 
 
 		 306 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  46.08 
 
 		 306 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  48.39 
 
 		 306 aa  177  8e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  48.37 
 
 		 305 aa  176  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  46.33 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  42.73 
 
 		 346 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  47.93 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  46.19 
 
 		 314 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  50.9 
 
 		 313 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  47 
 
 		 306 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  49.54 
 
 		 290 aa  170  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  48.65 
 
 		 310 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  46.6 
 
 		 306 aa  170  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  42.29 
 
 		 346 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  48.87 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  41.36 
 
 		 311 aa  168  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  48.11 
 
 		 308 aa  168  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  42.67 
 
 		 312 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  47.37 
 
 		 306 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  46.12 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  45.91 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  48.15 
 
 		 304 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 308 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 309 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  47.47 
 
 		 309 aa  161  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  46.64 
 
 		 312 aa  161  9e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  45.37 
 
 		 306 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  47 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  46.96 
 
 		 308 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  39.56 
 
 		 445 aa  158  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 313 aa  158  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  47.03 
 
 		 305 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  46.58 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  45.16 
 
 		 435 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  42.34 
 
 		 309 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  49.01 
 
 		 304 aa  156  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  38.43 
 
 		 319 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 447 aa  154  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  37.56 
 
 		 440 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 321 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  41.07 
 
 		 314 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  45.37 
 
 		 310 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  45.37 
 
 		 310 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  47.64 
 
 		 308 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  38.74 
 
 		 310 aa  148  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  48.58 
 
 		 308 aa  148  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  40 
 
 		 310 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  37.67 
 
 		 316 aa  147  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 		 319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  38.94 
 
 		 319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 		 319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  39.91 
 
 		 309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  38.94 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  38.94 
 
 		 319 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.3 
 
 		 322 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  39.35 
 
 		 428 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  39.82 
 
 		 307 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  38.94 
 
 		 319 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.45 
 
 		 321 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>