More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1718 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  100 
 
 		 306 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  96.41 
 
 		 306 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  82.57 
 
 		 305 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  73.86 
 
 		 306 aa  435  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  73.2 
 
 		 306 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  81.37 
 
 		 306 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  71.9 
 
 		 306 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  70.07 
 
 		 304 aa  362  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  62.91 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  60.46 
 
 		 305 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  57.53 
 
 		 308 aa  328  5.0000000000000004e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  57.1 
 
 		 306 aa  308  9e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  62.33 
 
 		 308 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  58.82 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  56.38 
 
 		 310 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  54.58 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  56.54 
 
 		 310 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  53.92 
 
 		 306 aa  295  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  55.63 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  55.59 
 
 		 306 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  50 
 
 		 310 aa  285  9e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  55.59 
 
 		 306 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  53.59 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  53.92 
 
 		 309 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  53.67 
 
 		 326 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  54.25 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  52.94 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  57.19 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  51.96 
 
 		 308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  47.84 
 
 		 310 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  57.72 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  57.72 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  52.98 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  51.64 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  53.31 
 
 		 309 aa  279  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  55.22 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  53.31 
 
 		 308 aa  278  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  52.32 
 
 		 308 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  51.97 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  51.64 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  57.84 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  51.14 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  53.29 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  51.19 
 
 		 306 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  58.17 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  48.85 
 
 		 307 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  52.3 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  57.84 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  56.16 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  45.61 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  54.79 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  54.45 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  54.79 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  47.35 
 
 		 305 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  45.81 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  50.49 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  51.01 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  52.88 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  50.49 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  47.44 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  53.4 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  51 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.33 
 
 		 306 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 313 aa  225  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  46.23 
 
 		 306 aa  223  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 311 aa  212  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  43.79 
 
 		 311 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  42.16 
 
 		 306 aa  211  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  43.46 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  44.16 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  40 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  40 
 
 		 310 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  42.05 
 
 		 314 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  41.44 
 
 		 311 aa  192  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2108  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  41.18 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 290 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  35.48 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  35.16 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 445 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  36.39 
 
 		 309 aa  172  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2228  inner-membrane translocator  50.54 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0851  inner-membrane translocator  37.32 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 440 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.32 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  33.87 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  35.84 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  37.96 
 
 		 447 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0429  inner-membrane translocator  36.23 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.335933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  35.31 
 
 		 425 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3024  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>