More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1246 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  100 
 
 		 311 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  96.46 
 
 		 311 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  73.95 
 
 		 311 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  69.26 
 
 		 312 aa  386  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  48.71 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  50.16 
 
 		 305 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  46.05 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.32 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  43.37 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  43.51 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  43.37 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  42.21 
 
 		 309 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  42.49 
 
 		 306 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  41.23 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  42.44 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  41.69 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  42.49 
 
 		 306 aa  188  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  41.69 
 
 		 326 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  43.13 
 
 		 306 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  44.98 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  41.85 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  44.98 
 
 		 306 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  44.86 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  42.77 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  39.41 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  43.41 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  44.66 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  40.39 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  46.95 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  43.69 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  46.73 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  40.39 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2228  inner-membrane translocator  51.57 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  44.95 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  44.22 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  41.58 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  46.2 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  43.56 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  41.21 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  44.37 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  42.43 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  41.32 
 
 		 435 aa  170  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  42.35 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  44.09 
 
 		 306 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  42.72 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  43.59 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  43.59 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  39.25 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  41.08 
 
 		 310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  41.02 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  43.26 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  42.52 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 310 aa  162  9e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0528  inner-membrane translocator  41.5 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 308 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 306 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  39.09 
 
 		 447 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  40.88 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  39.86 
 
 		 425 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  43.62 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  45.7 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  43.62 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  36.31 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 440 aa  155  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  42.99 
 
 		 307 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.99 
 
 		 314 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  35.24 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  40.67 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.33 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  36.22 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  36.22 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  36.92 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  36.92 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>