More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2445 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  100 
 
 		 306 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  87.58 
 
 		 306 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  86.89 
 
 		 306 aa  474  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  83.33 
 
 		 306 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  82.35 
 
 		 306 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  76.8 
 
 		 306 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  76.8 
 
 		 307 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  79.45 
 
 		 306 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5005  inner-membrane translocator  81.31 
 
 		 305 aa  431  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0805  putative transmembrane ABC transporter protein  74.91 
 
 		 306 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  72.04 
 
 		 306 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  63.73 
 
 		 306 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  70.61 
 
 		 306 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  63.73 
 
 		 306 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  71.68 
 
 		 306 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  71.68 
 
 		 306 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  63.4 
 
 		 306 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  62.42 
 
 		 306 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  62.42 
 
 		 306 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  52.81 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  52.61 
 
 		 306 aa  296  4e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1355  inner-membrane translocator  58.33 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  54.46 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  54.46 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  54.93 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1903  inner-membrane translocator  58.82 
 
 		 308 aa  279  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0838624  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  54.92 
 
 		 305 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2963  putative ABC type branched chain amino acid transport system  56.15 
 
 		 308 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.40426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  53.29 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  53.29 
 
 		 306 aa  262  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  53.29 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  47.32 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  50.17 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  50.84 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  50.33 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  49.32 
 
 		 308 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1119  inner-membrane translocator  50.99 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0373772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  50.68 
 
 		 309 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 308 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  50.68 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  50 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1718  inner-membrane translocator  51.64 
 
 		 306 aa  235  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3235  inner-membrane translocator  47.33 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3559  ABC transporter, inner membrane subunit  51 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.922335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5057  inner-membrane translocator  50.34 
 
 		 305 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.799835  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3242  inner-membrane translocator  51 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.165584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0494  inner-membrane translocator  51.01 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0299784  normal  0.0482055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1902  inner-membrane translocator  50.99 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.26134 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  47.49 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1691  inner-membrane translocator  52.05 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00294001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1416  inner-membrane translocator  51.68 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0189801  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1700  inner-membrane translocator  50.66 
 
 		 308 aa  221  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.132116 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4468  inner-membrane translocator  45.72 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0443774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  47.42 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6462  inner-membrane translocator  45.07 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.485911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  41.12 
 
 		 309 aa  215  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  45.15 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0930  inner-membrane translocator  48.15 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0214  inner-membrane translocator  47.96 
 
 		 306 aa  209  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1765  inner-membrane translocator  49.49 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.309051 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  42.53 
 
 		 313 aa  205  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.36 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1118  inner-membrane translocator  50.33 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0685582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 311 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2019  inner-membrane translocator  50.66 
 
 		 308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0492812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2147  inner-membrane translocator  47.37 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 308 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  43.14 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5417  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  43.37 
 
 		 311 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0534576  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2296  inner-membrane translocator  45.15 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2108  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4346  inner-membrane translocator  41.89 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3149  inner-membrane translocator  43.61 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.354296 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  35.43 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4476  inner-membrane translocator  38.63 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.83 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  36.88 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6455  inner-membrane translocator  38.57 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0310554 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.54 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  36.07 
 
 		 314 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  36.05 
 
 		 314 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  35.07 
 
 		 312 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  39.48 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2022  inner-membrane translocator  36.64 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0272  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  37.12 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  36.54 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>