More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2787 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2787  inner-membrane translocator  100 
 
 		 313 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  65.5 
 
 		 314 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  65.5 
 
 		 314 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2656  inner-membrane translocator  68.27 
 
 		 307 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3992  inner-membrane translocator  68.44 
 
 		 320 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180455  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  64.86 
 
 		 313 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5274  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  64.95 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1945  putative permease component of branched-chain amino acid transport system  65.29 
 
 		 314 aa  394  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280306  hitchhiker  0.0000756966 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3306  inner-membrane translocator  65.38 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1986  inner-membrane translocator  64.1 
 
 		 315 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.800217  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0954  inner-membrane translocator  63.38 
 
 		 315 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.383149  normal  0.118592 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0342  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  63.78 
 
 		 315 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2935  inner-membrane translocator  64.86 
 
 		 313 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4429  inner-membrane translocator  64.4 
 
 		 305 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.626915 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3578  inner-membrane translocator  65.18 
 
 		 307 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5334  inner-membrane translocator  65.92 
 
 		 314 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0934  inner-membrane translocator  65.71 
 
 		 314 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.509235  normal  0.234791 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  38.03 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  40 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  39.16 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4145  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 311 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  39.17 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01690  putative permease of ABC transporter  39.56 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.143832  normal  0.694457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0215  ABC transporter permease  39.56 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.709099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0679  inner-membrane translocator  37.58 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00497271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  39.24 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 312 aa  168  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 346 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1940  ABC transporter, inner membrane subunit  37.7 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0398259  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1509  branched chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2319  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.316553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1289  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.922436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  33.67 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3455  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0440389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1038  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0767  ABC transporter, permease protein  38.29 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0671  inner-membrane translocator  37.78 
 
 		 309 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2500  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.426672  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  34.87 
 
 		 307 aa  160  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  37.86 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2445  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  37.33 
 
 		 425 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 313 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0840  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0795  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.261256 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2058  ABC transporter permease  38.73 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.636859  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2175  transmembrane ABC transporter protein  39.09 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.537579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0767  inner-membrane translocator  35.28 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  37.34 
 
 		 310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1485  inner-membrane translocator  34.52 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  37.95 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3164  inner-membrane translocator  36.96 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.703733  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1978  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2378  inner-membrane translocator  37.79 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5876  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 306 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0568  ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1003  ABC transporter, inner membrane subunit  39.26 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 429 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0535  ABC transporter, permease protein  37.33 
 
 		 306 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  34.29 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3901  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.725338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  28.85 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  33.78 
 
 		 305 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1134  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1793  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 290 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0672209  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.36 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  32.82 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  32.47 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3175  inner-membrane translocator  41.75 
 
 		 306 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.397069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2137  inner-membrane translocator  35.66 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120618  normal  0.332234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3943  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  0.576427 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  28.43 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  32.68 
 
 		 440 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  32.21 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3630  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  33.13 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 319 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  34.21 
 
 		 447 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 323 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 321 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  28.75 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1064  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1061  inner-membrane translocator  38.93 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.597012  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2168  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.46 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00258855  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  28.75 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>