More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4461 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  100 
 
 		 323 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  96.28 
 
 		 323 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  81.73 
 
 		 323 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  72.14 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  68.42 
 
 		 323 aa  434  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  65.94 
 
 		 321 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  63.75 
 
 		 321 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  61.56 
 
 		 321 aa  401  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  63.44 
 
 		 322 aa  398  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  62.08 
 
 		 325 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  60.99 
 
 		 321 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  59.13 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  59.69 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  60.94 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  60.94 
 
 		 322 aa  371  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  55.79 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  57.76 
 
 		 324 aa  332  8e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  41.96 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  39.61 
 
 		 319 aa  229  6e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  42.26 
 
 		 307 aa  225  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  40.65 
 
 		 319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  41.9 
 
 		 303 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  38.94 
 
 		 319 aa  219  5e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  42.9 
 
 		 319 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  40.36 
 
 		 309 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  40.24 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  42.42 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  39.51 
 
 		 319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  39.21 
 
 		 319 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  39.51 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  39.51 
 
 		 319 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  39.21 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  40 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  39.21 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  40.5 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  38.91 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  39.21 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  38.08 
 
 		 312 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  41.27 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  36.78 
 
 		 318 aa  207  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  40.37 
 
 		 435 aa  206  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  40.25 
 
 		 300 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  39.06 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  37.26 
 
 		 311 aa  202  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  35.26 
 
 		 318 aa  199  5e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  40.07 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  34.88 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  36.45 
 
 		 318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  39.81 
 
 		 318 aa  195  7e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  38.39 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  37.73 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  37.3 
 
 		 440 aa  192  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 346 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  39.37 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  35.69 
 
 		 288 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.25 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  38.05 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  40.26 
 
 		 430 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  36.78 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 293 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  33.44 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  39.5 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  36.56 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 		 292 aa  172  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  37.46 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  35.03 
 
 		 445 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  36.71 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  36.16 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  37.06 
 
 		 435 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  34.43 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1950  inner-membrane translocator  35.92 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535854 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  35.22 
 
 		 444 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  32.26 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  32.09 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1925  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0121722 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 426 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3236  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 420 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0458  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>