More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0956 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  100 
 
 		 317 aa  623  1e-177  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  72.56 
 
 		 317 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  57.89 
 
 		 321 aa  334  9e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  56.7 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  52.68 
 
 		 317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  52.05 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  50.5 
 
 		 310 aa  292  6e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  47.81 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  46.56 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  47.19 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  46.25 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  45.94 
 
 		 319 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  47.5 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  47.19 
 
 		 319 aa  275  5e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  47.19 
 
 		 319 aa  275  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  47.19 
 
 		 319 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  47.19 
 
 		 319 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  46.23 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  48.49 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  47.02 
 
 		 319 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 319 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  41.48 
 
 		 318 aa  246  3e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  42.11 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  42.54 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  40.31 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  38.96 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  37.01 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  39.75 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  37.94 
 
 		 309 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  39.67 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  38.75 
 
 		 286 aa  186  5e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  38.61 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.22 
 
 		 425 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 321 aa  182  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  41.25 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  33.88 
 
 		 310 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  37.91 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  34.66 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  34.05 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  33.13 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 425 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  35.95 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  35.96 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  34.05 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.85 
 
 		 322 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 447 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf823  sugar ABC transporter permease protein  35.96 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  34.05 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 440 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 325 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  37.92 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  34.82 
 
 		 430 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  35.6 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 284 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0039  ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 296 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  31.46 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  34.73 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  36.51 
 
 		 346 aa  160  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl666  ribose ABC transporter permease component  36.31 
 
 		 299 aa  159  6e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0013  ribose/galactose ABC transporter  34.77 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  32.9 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  32.47 
 
 		 429 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  35 
 
 		 426 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  35.14 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  31.97 
 
 		 310 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  32.04 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  29.92 
 
 		 418 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 430 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 445 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  33.98 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  33.23 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1078  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 305 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  33.75 
 
 		 290 aa  149  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>