More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl666 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl666  ribose ABC transporter permease component  100 
 
 
299 aa  592  1e-168  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf823  sugar ABC transporter permease protein  37.26 
 
 
319 aa  188  1e-46  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0039  ABC transporter, permease protein  36.53 
 
 
325 aa  176  3e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0013  ribose/galactose ABC transporter  35.29 
 
 
309 aa  160  3e-38  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  33.65 
 
 
317 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
317 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  36.42 
 
 
309 aa  148  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  36.31 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0758  inner-membrane translocator  35.4 
 
 
317 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.516534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  32.65 
 
 
303 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  32.88 
 
 
286 aa  126  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3266  inner-membrane translocator  32.01 
 
 
321 aa  125  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395084  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
307 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  32.3 
 
 
425 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2256  inner-membrane translocator  32.69 
 
 
321 aa  122  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  29.62 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  32.97 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2037  inner-membrane translocator  32 
 
 
319 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.249578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  31.15 
 
 
319 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  31.35 
 
 
445 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  30.12 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  30.32 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  32.44 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  30.32 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  30.32 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  30.32 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  30.32 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  30.25 
 
 
319 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
307 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  29.94 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  31.48 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  28.62 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  30.92 
 
 
318 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  29.65 
 
 
321 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  31.68 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  29.68 
 
 
319 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  33.11 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  32.01 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  29.07 
 
 
321 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  29.02 
 
 
321 aa  109  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  28.98 
 
 
321 aa  109  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  29.24 
 
 
318 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  29.05 
 
 
312 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
319 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  29.5 
 
 
319 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  30.82 
 
 
325 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  28.16 
 
 
321 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  31.77 
 
 
317 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  27.59 
 
 
323 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  32.9 
 
 
301 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  27.59 
 
 
323 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  28.66 
 
 
305 aa  105  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  30.67 
 
 
310 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  30.54 
 
 
288 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  30 
 
 
306 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  30.49 
 
 
319 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  30.49 
 
 
319 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  29.22 
 
 
323 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  27.71 
 
 
321 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  31 
 
 
288 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 
293 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  27.19 
 
 
323 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  29.57 
 
 
310 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1315  inner-membrane translocator  30.1 
 
 
418 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  27.53 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  27.53 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  30.18 
 
 
320 aa  99  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  27.91 
 
 
319 aa  99  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  24.6 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  26.77 
 
 
323 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  27.48 
 
 
322 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  27.39 
 
 
310 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1004  inner-membrane translocator  31.39 
 
 
308 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4850  inner-membrane translocator  30.64 
 
 
310 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  29.28 
 
 
309 aa  95.9  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1246  inner-membrane translocator  28.39 
 
 
311 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.147742  normal  0.139079 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  27.48 
 
 
322 aa  95.5  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  29.47 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  29.63 
 
 
296 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  29.05 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  27.99 
 
 
430 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  30.98 
 
 
293 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4235  inner-membrane translocator  29.74 
 
 
308 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.169564  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1459  inner-membrane translocator  28.03 
 
 
290 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3178  inner-membrane translocator  29.62 
 
 
351 aa  90.5  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.686294  normal  0.1496 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2079  inner-membrane translocator  27.8 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal  0.0101179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  28.9 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  25.32 
 
 
309 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  30.29 
 
 
447 aa  89  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  27.13 
 
 
335 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  28.21 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  28.76 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1414  inner-membrane translocator  31.9 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.381128  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  29.53 
 
 
292 aa  86.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  24.68 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>