More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1788 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  100 
 
 
284 aa  560  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  100 
 
 
284 aa  560  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  63.57 
 
 
286 aa  363  2e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
309 aa  247  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  44.18 
 
 
312 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  41.58 
 
 
305 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  40.98 
 
 
300 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  43.65 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  43.71 
 
 
308 aa  221  8e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  43.66 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  40.94 
 
 
319 aa  219  3e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  40.13 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  42.14 
 
 
310 aa  219  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  42.24 
 
 
319 aa  218  7e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  39.26 
 
 
319 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  41.69 
 
 
319 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  39.26 
 
 
319 aa  217  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  43.66 
 
 
288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  41.69 
 
 
319 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  42.02 
 
 
319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  42.02 
 
 
319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  39.62 
 
 
425 aa  214  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  41.69 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  41.69 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  42.12 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  43.16 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  40.89 
 
 
307 aa  211  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  40.61 
 
 
303 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  40.6 
 
 
319 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
307 aa  210  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  38.1 
 
 
321 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  41.22 
 
 
316 aa  208  6e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  41.95 
 
 
344 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  38.94 
 
 
346 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  36.96 
 
 
306 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  38.01 
 
 
321 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  39.32 
 
 
309 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  39.01 
 
 
325 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  39.05 
 
 
321 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  40.44 
 
 
317 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  40 
 
 
319 aa  202  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  39.75 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  39.27 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  39.06 
 
 
312 aa  199  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  38.73 
 
 
321 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  40.82 
 
 
425 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  38.49 
 
 
321 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.37 
 
 
322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  41.34 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  38.19 
 
 
318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  39.05 
 
 
322 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  40.39 
 
 
319 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  38.83 
 
 
318 aa  193  3e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
445 aa  192  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  40.21 
 
 
292 aa  192  7e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  38.61 
 
 
323 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  36.71 
 
 
323 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  39.46 
 
 
440 aa  190  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  39.93 
 
 
435 aa  189  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  38.67 
 
 
301 aa  188  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  39.19 
 
 
304 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  40.4 
 
 
426 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  37.34 
 
 
323 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  38.34 
 
 
323 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  38.02 
 
 
321 aa  186  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  36.19 
 
 
318 aa  185  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  37.58 
 
 
429 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  36.3 
 
 
305 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  38.75 
 
 
314 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  38.08 
 
 
435 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  38.98 
 
 
447 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0458  inner-membrane translocator  40.85 
 
 
293 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  37.26 
 
 
322 aa  181  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  38.41 
 
 
426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  37.7 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
430 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1660  ABC transporter, permease protein  39.79 
 
 
293 aa  177  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
335 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  39.42 
 
 
318 aa  176  3e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  39.46 
 
 
310 aa  176  5e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0699  ribose/galactose ABC transporter, permease protein  34.32 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  41.45 
 
 
430 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  38.49 
 
 
320 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  38.19 
 
 
317 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5246  inner-membrane translocator  34.46 
 
 
305 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1409  inner-membrane translocator  38.57 
 
 
313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00403433  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  40.07 
 
 
429 aa  165  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  35.62 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1593  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
296 aa  162  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.42882 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2518  inner-membrane translocator  34.72 
 
 
305 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  36.05 
 
 
310 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0564  inner-membrane translocator  33.86 
 
 
324 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.163517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  37.83 
 
 
428 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  35.41 
 
 
444 aa  155  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  33.88 
 
 
310 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3028  inner-membrane translocator  35.74 
 
 
308 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.921735 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0473  inner-membrane translocator  34.86 
 
 
299 aa  155  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000422967  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  34.35 
 
 
313 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>