More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1779 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1779  inner-membrane translocator  100 
 
 
309 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000172094  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0404  inner-membrane translocator  69.28 
 
 
306 aa  434  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0341436  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0030  inner-membrane translocator  61.51 
 
 
305 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0007  inner-membrane translocator  44.41 
 
 
319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00338005  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0019  inner-membrane translocator  44.52 
 
 
319 aa  265  5e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0158  inner-membrane translocator  45.92 
 
 
307 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.488048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0842  inner-membrane translocator  43.27 
 
 
319 aa  253  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0819  inner-membrane translocator  43.27 
 
 
319 aa  253  3e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08800  inner-membrane translocator  47.83 
 
 
309 aa  252  6e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00310971  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25730  nucleoside ABC transporter membrane protein  43.1 
 
 
425 aa  245  8e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.465825  normal  0.436724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2603  inner-membrane translocator  40.51 
 
 
312 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210052  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1677  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
316 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249987  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04920  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  42.23 
 
 
435 aa  227  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1213  inner-membrane translocator  41.08 
 
 
440 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000233246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1140  inner-membrane translocator  42.76 
 
 
447 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1155  inner-membrane translocator  42.37 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.669873  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21250  uncharacterized ABC-type transport system, permease component  41.39 
 
 
444 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1650  inner-membrane translocator  44.59 
 
 
303 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2440  inner-membrane translocator  40.94 
 
 
319 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245411  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2944  inner-membrane translocator  42.18 
 
 
429 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1581  inner-membrane translocator  43 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.788444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4461  inner-membrane translocator  40.24 
 
 
323 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.51963 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1412  sugar ABC transporter, permease protein  40.62 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0105551  normal  0.047253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3559  inner-membrane translocator  40.94 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.706735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3887  sugar ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.140274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3692  inner-membrane translocator  42.95 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.24708  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3548  ABC transporter, permease  40 
 
 
319 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0423  inner-membrane translocator  42.24 
 
 
300 aa  212  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3823  sugar ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
319 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3801  sugar ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
319 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000466653 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3530  ABC transporter, permease  40.31 
 
 
319 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3836  sugar ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
319 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000105627  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0639  inner-membrane translocator  42.09 
 
 
309 aa  210  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0859  ABC transporter permease  38.44 
 
 
318 aa  210  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0751  inner-membrane translocator  40.89 
 
 
301 aa  208  8e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000454798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4173  inner-membrane translocator  38.72 
 
 
323 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1609  ABC transporter permease  38.17 
 
 
318 aa  207  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.342932  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3584  ABC sugar transporter inner membrane translocator  40.13 
 
 
321 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0525  inner-membrane translocator  37.38 
 
 
321 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1788  inner-membrane translocator  39.32 
 
 
284 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1149  inner-membrane translocator  39.32 
 
 
284 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0506  inner-membrane translocator  37.97 
 
 
286 aa  206  5e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3638  branched-chain amino acid transport system, permease component, C-terminus  41.5 
 
 
344 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2766  inner-membrane translocator  38.51 
 
 
314 aa  205  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3946  inner-membrane translocator  41.14 
 
 
435 aa  205  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00765418 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0635  inner-membrane translocator  41.16 
 
 
322 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3847  inner-membrane translocator  39.42 
 
 
425 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193148  decreased coverage  0.00000485883 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2285  inner-membrane translocator  37.82 
 
 
321 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.345372  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3339  inner-membrane translocator  39.56 
 
 
323 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4194  inner-membrane translocator  43.06 
 
 
428 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0728  inner-membrane translocator  40.84 
 
 
321 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000259102  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1300  ABC sugar transporter inner membrane translocator  39.23 
 
 
321 aa  202  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0827  inner-membrane translocator  43.1 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.868733  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0810  inner-membrane translocator  41.64 
 
 
426 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.782649 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3657  inner-membrane translocator  38.62 
 
 
315 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.103238 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2071  inner-membrane translocator  42.16 
 
 
319 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0260  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  39.49 
 
 
323 aa  198  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0918  inner-membrane translocator  42.42 
 
 
276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1633  inner-membrane translocator  38.24 
 
 
346 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00905932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0754  inner-membrane translocator  40.27 
 
 
426 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.56279  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2846  inner-membrane translocator  37.82 
 
 
321 aa  195  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207886  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1179  inner-membrane translocator  40.85 
 
 
319 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0957  sugar ABC transporter, permease protein, putative  36.25 
 
 
318 aa  192  4e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.192021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1318  inner-membrane translocator  39.54 
 
 
346 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.484176 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0145  inner-membrane translocator  41.03 
 
 
307 aa  193  4e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1549  sugar ABC transporter  38.44 
 
 
317 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.221473  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0524  inner-membrane translocator  38.01 
 
 
288 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1355  inner-membrane translocator  38.26 
 
 
430 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1829  ABC transporter, permease protein  37.58 
 
 
317 aa  192  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2208  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.18 
 
 
322 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312232  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0856  inner-membrane translocator  36.89 
 
 
325 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115624  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3654  inner-membrane translocator  40 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0883  inner-membrane translocator  37.18 
 
 
322 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0630  inner-membrane translocator  37.97 
 
 
293 aa  189  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3097  inner-membrane translocator  38.58 
 
 
335 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11064  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0480  inner-membrane translocator  39.16 
 
 
288 aa  185  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3053  inner-membrane translocator  36.31 
 
 
445 aa  185  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0075  ABC transporter permease  36.96 
 
 
318 aa  183  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0137  putative simple sugar transport system permease protein  35.41 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0697381  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4010  inner-membrane translocator  38.33 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07950  nucleoside ABC transporter membrane protein  40.74 
 
 
444 aa  182  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1023  inner-membrane translocator  40.89 
 
 
430 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1691  inner-membrane translocator  39.16 
 
 
304 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1947  ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 
310 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0161328  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0638  inner-membrane translocator  35.9 
 
 
299 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1454  ABC transporter permease  38.11 
 
 
317 aa  175  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0298  inner-membrane translocator  38.38 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000156884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0956  inner-membrane translocator  37.94 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2174  inner-membrane translocator  35.08 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0519  inner-membrane translocator  37.41 
 
 
293 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1924  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
310 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323081  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6251  inner-membrane translocator  35.34 
 
 
303 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.475963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2992  inner-membrane translocator  37.09 
 
 
308 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0785712 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0997  inner-membrane translocator  40.21 
 
 
429 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.382642  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6177  inner-membrane translocator  32.15 
 
 
314 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434416  normal  0.252013 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0156  ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1909  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1301  inner-membrane translocator  30.49 
 
 
313 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0556044  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6736  inner-membrane translocator  40.58 
 
 
320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6356  inner-membrane translocator  32.48 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420004  normal  0.20423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>